Übung Conotoxine:

Aufgabe:

Suchen Sie 3-4 Conotoxine der Länge <20 aus der PDB. Färben Sie Sekundärstrukturelemente und Cysteine so, dass ein anschaulicher Strukturvergleich möglich ist.

Skript:

cmd.hide("everything","1NOT")
cmd.show("cartoon" ,"1NOT")
util.cbss("1NOT","red","yellow","green")
select pos,(resn cys)
cmd.color(2,"pos")
cmd.orient("visible",animate=-1)
cmd.center("visible",animate=-1)
cmd.disable('pos')
ray 1200, 900

Ergebnis:

3 Conotoxine < 20 AS: 1HJE 1NOT 1QMW
Cystein ist blau markiert