PSI-Blast:

verwendet wurden  PAX6_HUMAN P26367 und INS_HUMAN P01308

Parameter: blastpgp -d swiss -o pax6.psiblast -i p26367.fasta -Q pax6.mat -j 25 -b 0 -v 10000 kombiniert wurden -e 1e-1 -h 1e-1 und -e 1e-7 -h 1e-7

Programm:

Abwandlung des filetimestamp.pl Programms zur Auswertung der Datei pax.mat und ihrer Veränderung während des Blastlaufs: psiblast.pl

Programm zur Auswertung: blat4psiblast.pl

Auswertung:

PAX6_HUMAN: Entwicklung der Zahl der neugefundenen Sequenzen -e 1e-7 -h 1e-7

PAX6_HUMAN: Entwicklung des durchschnittlichen Informationsgehalts -e 1e-7 -h 1e-7

PAX6_HUMAN: Entwicklung des Evalue im Lauf der Verfeinerung -e 1e-7 -h 1e-7

PAX6_HUMAN: Entwicklung der Zahl der neugefundenen Sequenzen -e 1e-1 -h 1e-1

PAX6_HUMAN: Entwicklung des durchschnittlichen Informationsgehalts -e 1e-1 -h 1e-1

PAX6_HUMAN: Entwicklung des Evalue im Lauf der Verfeinerung -e 1e-1 -h 1e-1

INS_HUMAN: Entwicklung der Zahl der neugefundenen Sequenzen -e 1e-7 -h 1e-7

INS_HUMAN: Entwicklung des durchschnittlichen Informationsgehalts -e 1e-7 -h 1e-7

INS_HUMAN: Entwicklung des Evalue im Lauf der Verfeinerung -e 1e-7 -h 1e-7

INS_HUMAN: Entwicklung der Zahl der neugefundenen Sequenzen -e 1e-1 -h 1e-1

INS_HUMAN: Entwicklung des durchschnittlichen Informationsgehalts -e 1e-1 -h 1e-1

INS_HUMAN: Entwicklung des Evalue im Lauf der Verfeinerung -e 1e-1 -h 1e-1